Ph.d.-stipendiat med ekspertise i bioinformatik til forskningsprojekt i krydsfeltet mellem cancer genomics og immunologi

Afdeling for Klinisk Immunologi, Rigshospitalet, Københavns Universitetshospital

Tiltrædelse: 01.09.2026 eller efter aftale

Vi søger en engageret og selvstændig ph.d.-stipendiat med bioinformatisk baggrund til et højt specialiseret forskningsmiljø på Rigshospitalet. Stillingen er knyttet til et forskningsprojekt om identifikation af neoantigener ved akut leukæmi. Neoantigener er meget lovende mål for immunterapi, som vi vil identificere på baggrund af long-read sekventering, in silico-neoantigenprædiktion og immunologisk targetvalidering.

Projektet er primært forankret på Afdeling for Klinisk Immunologi, men gennemføres i tæt samarbejde med Danmarks Tekniske Universitet (DTU), Center for Cancer Immunterapi på Herlev Hospital samt Charité Berlin, Tyskland. Neoepitopprædiktionen udføres i samarbejde med prof. Morten Nielsen på DTU, og den ph.d.-studerende forventes derfor at tilbringe en mindre del af projektperioden på DTU.

Du bliver en central del af et tværfagligt team, der kombinerer moderne genomiske og immunologiske teknologier i translationel cancerforskning. Arbejdet omfatter både bioinformatisk pipelineudvikling, analyse af genomiske og transkriptomiske data, neoantigenprædiktion samt integrativ datafortolkning.

Stillingen er knyttet til Sektion for Diagnostisk Immunologi, som varetager diagnostiske analyser af pædiatriske patienter med leukæmi/lymfom i Østdanmark og er nationalt center for monitorering af minimal restsygdom (MRD) for alle danske børn og unge med akut leukæmi behandlet efter de fælleseuropæiske behandlingsprotokoller (ALLtogether/CHIP-AML22). Sektionen dækker derudover diagnostik af immundefekter, immunologisk dysfunktion og autoimmunitet og har en bred forskningsprofil.

Kvalifikationer
Vi søger en kandidat med følgende profil:

• Kandidatgrad i bioinformatik (cand.polyt.)
• Dokumenteret erfaring med analyse af long-read sekventeringsdata fra patienter med akut lymfoblastær leukæmi (ALL) vil blive prioriteret højt
• Erfaring med analyse af genomiske og transkriptomiske data, samt erfaring med HLA-type identifikation, er en fordel
• Arbejder struktureret og selvstændigt
• Er en holdspiller, der trives i tværfagligt samarbejde

Ansættelsesvilkår
Arbejdstiden er 37 timer om ugen. Stillingen er en tidsbegrænset ph.d.-stilling på 3 år. Ansættelsen forudsætter indskrivning som ph.d.-studerende ved Det Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet, og at ansøgeren opfylder fakultetets adgangskrav.

Løn- og ansættelsesvilkår følger overenskomst for akademikere ansat i regionerne, indgået mellem Akademikerne (AC) og Regionernes Lønnings- og Takstnævn, samt gældende protokollat for ph.d.-stipendiater.

Yderligere oplysninger om stillingen kan fås ved henvendelse til de projektansvarlige læger:

Marius-Konstantin Klever, MD, PhD ( Se e-mailadresse på studerendeonline.dk )

Signe Modvig, MD, PhD, klinisk lektor, master i bioinformatik, afdelingslæge ( Se e-mailadresse på studerendeonline.dk )

Ansøgning, CV, eksamensbevis og eventuelle andre relevante dokumenter skal indsendes via linket i opslaget senest den 31. juli 2026.

Ansøgningsfrist: d. 31. juli 2026

Lokation: Rigshospitalet